Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTRK2Q16620 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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