Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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VAMP3Q15836 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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VAMP3Q15836 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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VAMP3Q15836 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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