Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NECTIN1Q15223 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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NECTIN1Q15223 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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NECTIN1Q15223 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NECTIN1Q15223 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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