Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
R3HDM1Q15032 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
R3HDM1Q15032 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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