Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERV3-1Q14264 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms