Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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