Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLFN5Q08AF3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLFN5Q08AF3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms