Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLOD1Q02809 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms