Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP107P57740 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP107P57740 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms