Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF6P49848 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF6P49848 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms