Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARCN1P48444 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms