Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPA9P38646 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPA9P38646 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPA9P38646 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPA9P38646 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPA9P38646 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms