Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER4P35408 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms