Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT1P26358 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT1P26358 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms