Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms