Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms