Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms