Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSD2O96028 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD2O96028 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD2O96028 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms