Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN25C9JDP6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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