Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms