Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms