Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA6Q9UF33 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms