Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms