Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EHD3Q9NZN3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms