Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERINC1Q9NRX5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms