Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms