Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1EQ9GZS1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms