Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms