Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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TTC21AQ8NDW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC21AQ8NDW8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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