Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYNE4Q8N205 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNE4Q8N205 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms