Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3L3Q68CJ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms