Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00303Q3SY05 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms