Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms