Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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