Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRADDQ15628 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRADDQ15628 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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