Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3GAP1Q15042 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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