Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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GBX1Q14549 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX1Q14549 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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