Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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PEX6Q13608 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PEX6Q13608 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PEX6Q13608 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PEX6Q13608 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PEX6Q13608 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX6Q13608 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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PEX6Q13608 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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