Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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