Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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TUBB3Q13509 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TUBB3Q13509 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TUBB3Q13509 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TUBB3Q13509 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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