Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SP140Q13342 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP140Q13342 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP140Q13342 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP140Q13342 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP140Q13342 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP140Q13342 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP140Q13342 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP140Q13342 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SP140Q13342 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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