Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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