Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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