Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TFF3Q07654 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TFF3Q07654 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms