Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms