Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms