Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK2A1P68400 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms