Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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