Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms