Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms